本发明公开了一种用于测试策略灵活组态稳控系统的方法及系统，属于电力系统保护与控制技术领域。本发明方法，包括：将稳控系统的基础策略表下发至稳控系统的稳控主机，控制稳控主机解析基础策略表，确定策略表要求，并根据策略表要求，灵活组态自动生成程序软件；将策略触发条件局部调整、新增策略触发条件、新增策略触发条件及监视回路、新增切机执行站、调整策略监测断面、和新增策略类型作为测试指标；针对测试指标，调整测试条件，对稳控系统生成的程序软件进行测试，并确定测试结果是否满足程序软件的执行条件，完成测试。本发明可对策略灵活组态的稳控系统进行全面验证和测试。