本发明涉及一种存储器控制器，其耦接一存储器装置与一主机装置，用以控制存储器装置的存取操作，包括一缓冲存储器、一主机接口、一微处理器以及一数据保护引擎。主机接口耦接主机装置，用以将自主机装置接收的数据写入缓冲存储器，并且于数据被写入缓冲存储器后，发出一缓冲存储器写入完成通知。微处理器响应于缓冲存储器写入完成通知触发一数据保护操作。数据保护引擎用以根据储存于缓冲存储器的数据执行数据保护操作以产生对应的保护资讯。微处理器于确认数据被写入缓冲存储器后直接触发数据保护操作。