本发明公开了一种智能化无接触核酸样品运输系统及其工作方法，系统包括核酸采样管登记及收纳装置，导航寻路机器人递送系统，无人机转运系统，样本盒回收及保存系统。通过核酸采样管登记及收纳装置实现了核酸样品管的自动传送、检测登记、消杀处理以及样品管装入核酸样品盒，同时装有样品管的核酸样品盒依次通过导航寻路机器人递送系统、无人机转运系统最终传送到样本盒回收及保存系统，中间避免了人员接触，全程实现核酸样本盒自动转移、运输，且全程各个转运环节均自动消杀，有效减轻核酸样品运输过程中的人力资源损耗，最大限度保护参与人员健康，避免交叉感染，提高核酸样品处理及运输效率。