本发明给出了一种基于内网系统的手机数据并行采集方法和系统，包括响应于待采集数据手机接入采集系统并开启采集软件，采集口处的微控制单元对手机连接端口进行初始化；微控制单元检测到待采集数据手机，在手机连接端口处的随机存取存储器内建立第一数据缓冲区并将获取到的特征信息写入第一数据缓冲区；微控制单元控制过滤器对获取的数据进行校验和数据包的碰撞检测，过滤待采集数据手机的网络设备并保留获取到待采集数据手机的有效数据；在主机连接端口建立第二数据缓冲区，将有效数据写入第二数据缓冲区，建立与主机的数据通信通道。该方法和系统大大提供工作效率，同时能够保证数据的安全性和完整性。