本发明公开了一种聚酯薄膜及其制备方法，聚酯薄膜采用A/B/C三层结构共挤，双向拉伸而成，所述A层由3wt％～20wt％的功能母料X和80wt％～97wt％的纯净聚酯切片组成，所述C层由5wt％～30wt％的功能母料Y和70wt％～95wt％的纯净聚酯切片组成，所述C层表面粗糙度Sa＜15nm，A层与C层厚度相同或者不同。聚酯薄膜厚度为12μm～250μm。本发明的聚酯薄膜兼具有表面粗糙度低、易粘着、高光泽、表观无划伤/蹭伤等优点，大大提高了产品质量，提升了中下游客户深加工产品良率，简化了生产工艺，降低了生产成本。产品可广泛用于高端MLCC/LTCC离型膜、IMR、板材上光、高端离保膜等诸多领域。