本发明公开了一种基于光源控制器的多通道光源控制方法及系统；其中，所述方法包括：控制器接收到所述光源控制指令，并解析控制指令获得其对应的控制模式；在控制模式为PWM模式时，控制器接收环境光传感器采集当前环境亮度信息数据；控制器基于当前环境亮度信息数据及设定的用户基准亮度值进行计算，并生成光源触发指令；控制器将所述光源触发指令发送至I/O中断模块中形成触发信号，并基于I/O中断模块的其中一输出通道输出至定时器中；定时器将接收到的触发信号输入至光源的内置驱动器上，触发所述内置驱动器驱动所述光源工作。在本发明实施例中，可以保证光源的亮度和稳定性，并且减少对光源控制的延时，提高用户使用体验。