本发明公开了一种GIS母线刀闸分合闸位置异常自动分析方法和系统，自动记录电网数据，在刀闸操作前，自动导入操作票或调令票，识别操作票或调令票中涉及母线侧刀闸的操作步骤，自动调取变电站的主接线形式和操作逻辑，分析本站设备能提供的GIS母线刀闸分合闸位置异常情况的全部判据种类，自动识别刀闸动作前后的网络拓扑、运行方式和刀闸操作过程，开展实时判断，对GIS母线刀闸分合闸位置异常情况进行分析判断，输出异常判断结果，不需要依赖于运行人员的工作经验，解决了现有的间接判断GIS设备母线刀闸分合闸位置异常方法效率低、精度低，而且对人员的技能水平依赖高，缺乏统一的判断标准，容易发生人为误判的技术问题。