本发明属于主动控制技术领域，具体涉及一种基于电子回旋波的阿尔芬模实时控制系统及方法。本发明中，多通道电子回旋辐射计、多通道微波反射计、米尔诺夫探针与磁约束高温等离子体和阿尔芬模智能识别算法连接、阿尔芬模智能识别和控制算法与中央处理器连接、中央处理器与电子回旋共振加热控制系统连接，电子回旋共振加热控制系统与回旋管连接，回旋管与槽纹波导、真空法兰、可控角度天线系统依次连接，可控角度天线系统与磁约束高温等离子体连接。本发明能够实时高时空分辨率测量阿尔芬模的空间位置等基本信息，快速智能完成阿尔芬模的识别和鉴定并能够精确控制微波注入角度从而实现阿尔芬模的实时控制。