本发明公开了一种印记基因的甲基化作为心脑血管疾病早期诊断的标志物。本发明提供了甲基化SLC22A18基因作为标志物在制备产品中的应用，所述产品的用途为如下至少一种：辅助诊断心脑血管疾病或在临床症状之前预警心脑血管疾病；辅助诊断冠心病或在临床症状之前预警冠心病；辅助诊断脑卒中或在临床症状之前预警脑卒中；辅助区分冠心病和脑卒中；辅助诊断不同临床特征的冠心病或在临床症状之前预警不同临床特征的冠心病；辅助诊断不同临床特征的脑卒中或在临床症状之前预警不同临床特征的脑卒中。本发明对提高心脑血管疾病早期诊疗效果和降低死亡率均有重要的科学意义和临床应用价值。