- 专利标题: 一种基于多视角学习的蛋白质溶剂可及性预测方法
-
申请号: CN202110558859.4申请日: 2021-05-21
-
公开(公告)号: CN113361752B公开(公告)日: 2022-07-26
- 发明人: 胡俊 , 樊学强 , 白岩松 , 郑琳琳 , 张贵军
- 申请人: 浙江工业大学
- 申请人地址: 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号
- 专利权人: 浙江工业大学
- 当前专利权人: 浙江工业大学
- 当前专利权人地址: 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号
- 代理机构: 杭州斯可睿专利事务所有限公司
- 代理商 王利强
- 主分类号: G06Q10/04
- IPC分类号: G06Q10/04 ; G06N3/04 ; G06N3/08 ; G16B15/20
摘要:
一种基于多视角学习的蛋白质溶剂可及性预测方法,根据输入的待测定蛋白质溶剂可及性的蛋白质序列信息,使用HHblits工具生成对应的多序列联配信息,基于多序列联配信息,生成对应的位置特异性频率矩阵;使用PSI‑BLAST工具生成对应的位置特异性得分矩阵,使用PSIPRED工具生成对应的二级结构信息;搭建多视角学习神经网络框架,并从PDB库中收集已注释三级结构信息的所有蛋白质,生成蛋白质的特征信息,与对应的标签组成数据集,使用多视角学习神经网络框架在数据集上学习预测模型;将待进行蛋白质溶剂可及性预测的特征信息输入模型中,得到蛋白质溶剂可及性的预测结果。本发明计算代价低、预测精度高。
公开/授权文献
- CN113361752A 一种基于多视角学习的蛋白质溶剂可及性预测方法 公开/授权日:2021-09-07