一种基于多视角学习的蛋白质溶剂可及性预测方法
摘要:
一种基于多视角学习的蛋白质溶剂可及性预测方法,根据输入的待测定蛋白质溶剂可及性的蛋白质序列信息,使用HHblits工具生成对应的多序列联配信息,基于多序列联配信息,生成对应的位置特异性频率矩阵;使用PSI‑BLAST工具生成对应的位置特异性得分矩阵,使用PSIPRED工具生成对应的二级结构信息;搭建多视角学习神经网络框架,并从PDB库中收集已注释三级结构信息的所有蛋白质,生成蛋白质的特征信息,与对应的标签组成数据集,使用多视角学习神经网络框架在数据集上学习预测模型;将待进行蛋白质溶剂可及性预测的特征信息输入模型中,得到蛋白质溶剂可及性的预测结果。本发明计算代价低、预测精度高。
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