本发明提供了一种鉴别粳籼稻品种的方法，采用成熟种子中饱和甘油三酯含量高低来区分粳稻和籼稻品种。具体以籼型常规水稻品种IR64中饱和甘油三酯含量作为参照值，待测品种种子中，饱和甘油三脂含量高于籼型常规水稻品种IR64中饱和甘油三脂含量1％以上的，判断为籼稻品种，低于籼型常规水稻品种IR64中饱和甘油三脂含量1％以下的，判断为粳稻品种。本发明首次提出用成熟种子饱和甘油三酯来区分粳籼稻品种，对研究水稻分类、进化和基因功能研究具有参考和应用价值，同时为水稻杂志优势应用研究提供了新思路。