本发明公开了一种高生物利用度的续断皂苷VI的提取纯化方法，取续断药材通过乙醇提取，提取液减压回收溶剂，加入NaCl溶液溶解，加入乳化剂并保持温度搅拌析出沉淀，沉淀过滤，得到的沉淀用乙醇溶解，回收溶剂，再用NaCl溶液溶解，加入乳化剂，保持温度搅拌析出沉淀，沉淀过滤，得到的沉淀用NaCl溶液溶解，加入乳化剂，保持温度搅拌析出沉淀，过滤沉淀，干燥即得高纯度续断皂苷VI。本发明的原料来源丰富、价廉，整个制备过程中避免了有毒试剂的使用，安全低毒，制备工艺简单，分离纯化效率高，大大提高了产物的纯度和产率，且得到续断皂苷VI生物利用度高，成药性好，适于工业化生产，容易推广应用。