本发明公开了种植行业领域的一种富硒辣椒种植器及其种植方法，以克服现有技术中在人工操作时往往会导致辣椒苗根部与土壤的没入程度过深，同时翻转的土壤比较疏松，导致辣椒与土壤结合不紧密，产生烧根现象的缺陷，为了克服上述缺陷本技术方案中包括传输带和位于传输带输送末端的种植筒，所述种植筒的内部沿辣椒种植方向依次带有导向机构和用于扶苗的偏振机构，种植筒的外侧间隙配合有套筒，种植筒与套筒之间连接有拉簧，套筒的一侧带有顶出机构，本技术方案中利用顶出机构将种植筒和辣椒苗进行混合，以种植筒自身的容积恒定辣椒苗根部与土壤的没入程度，保证秧苗的根部与土壤能够密切贴合。