本发明属于UV固化材料技术领域，具体涉及一种植物油基阻燃聚氨酯丙烯酸酯预聚物及其制备方法和应用。本发明将环氧植物油与二乙基磷乙酸反应制备生物基含磷多元醇，将氨基硅氧烷与丙烯酸羟基酯反应制备含硅单体，然后将丙烯酸羟基酯、生物基含磷多元醇、含硅单体与二异氰酸酯反应制备植物油基阻燃聚氨酯丙烯酸酯预聚物。本发明通过在植物油基聚氨酯丙烯酸酯预聚物分子链中引入绿色环保的磷、硅元素，使得固化膜能够具有很好的阻燃性能，能够克服传统植物油基高分子材料容易燃烧的缺点，有利于扩大生物基高分子材料的应用范围。