本发明公开了一种磁悬浮系统的转子位置确定方法、装置、磁悬浮系统、存储介质及处理器，该方法包括：获取所述磁悬浮系统的转子的直径；所述磁悬浮系统的转子，是所述磁悬浮系统的磁悬浮转子；确定所述磁悬浮系统的转子的第一设定参考位置，并确定所述磁悬浮系统的转子的第二设定参考位置；根据所述第一设定参考位置、所述第二设定参考位置和所述直径，确定所述磁悬浮系统的转子的实际参考位置。该方案，通过使转子采用软起浮的方式到达设定参考位置，根据设定参考位置确定转子的实际参考位置，能够降低磁悬浮系统的转子位置的确定难度。