本发明公开了一种在镁合金表面制备超疏水复合涂层的方法，属于金属材料表面处理及改性领域。本发明首先将清洗并干燥后的镁合金基体放入混合酸溶液中刻蚀2min，以获得粗糙表面；然后将壳聚糖乙酸水溶液作为涂覆溶液，采用浸渍提拉法将刻蚀后的镁合金试样涂覆2‑8次，以制备中间层；随后将覆有中间层的镁合金试样放入由氯化锌、氯化钙和磷酸二氢钠配制的反应溶液中，在50‑90℃下反应15‑150min，构筑出具有微米级球状结构的涂层；最后利用硬脂酸乙醇溶液对所制备的微米级球状复合涂层进行低表面能处理，获得超疏水涂层。本发明制备的超疏水复合涂层具有良好的自清洁和超疏水特性，能够显著提高基体的耐腐蚀性能；而且该方法成本低廉、生产周期短，适用于具有各种形状和尺寸的镁合金。