本发明实施方式提供一种分布式的星上自主任务规划方法、系统及存储介质，属于遥感监测技术领域。所述方法包括：同步每颗卫星的单星任务集合以组成总任务集合；每颗所述卫星依据时间窗计算方法根据对应的所述单星任务集合形成对应的任务序列；根据预设的任务规划方法对所述任务序列进行处理以得到每颗所述卫星的初始规划方案；迭代计算所述初始规划方案以得到最终的任务规划方案；在每颗所述卫星之间同步所述任务规划方案。该方法、系统及存储介质能够提高多卫星任务规划的自主性和实效性。