本发明公开了一种含噻唑结构的抗菌苯丙乳液及其制备方法和应用。本发明所述一种含噻唑结构的抗菌苯丙乳液，由75～108质量份苯乙烯、125～180质量份丙烯酸丁酯、3～25质量份(甲基)丙烯酸、25～100质量份含噻唑结构的(甲基)丙烯酸酯单体、8～55质量份乳化剂、1～6质量份引发剂、3～25质量份pH值调节剂和400～720质量份去离子水通过乳液聚合得到。本发明所述含噻唑结构的(甲)丙烯酸酯抗菌功能单体能赋予苯丙乳液持久抗菌性能，对制备苯丙乳液的稳定性、固含量、凝胶率、单体转化率等乳液性能基本没有影响。本发明所述含噻唑结构的抗菌苯丙乳液可用于制备具有持久抗菌性的乳胶漆。