本发明涉及一种柔性直流输电系统的桥臂电流应力降低方法及系统，属于新能源及电力工程技术领域，采集同一时刻换流阀三相桥臂的每一相的上桥臂电流、下桥臂电流；计算换流阀三相桥臂的桥臂盈余电流，通过该桥臂盈余电流体现换流阀三相不平衡程度，如果桥臂盈余电流大于预设的盈余电流保护定值，则执行桥臂过流保护动作，如果桥臂盈余电流不大于预设的盈余电流保护定值，则由常规过电流保护执行桥臂过流保护动作，解决了现有技术中存在的换流阀桥臂电流应力抑制效果差、成本高的问题。