本发明公开了一种大变形预应力水力膨胀锚杆的使用方法。它包括如下步骤，步骤一：在围岩上形成钻孔；步骤二：将大变形预应力水力膨胀锚杆放入钻孔中，通过注水口向水力膨胀内壳与水力膨胀外壳之间注水，使水力膨胀外壳紧贴钻孔孔壁、且水力膨胀内壳紧贴内杆结构，通过托盘和螺母将内杆结构固定在钻孔中；水力膨胀外壳的径向膨胀对钻孔施加锚杆杆体径向预应力，通过托盘和螺母施加锚杆杆体轴向预应力；步骤三：当围岩发生变形时，通过内杆锥头和锥头胀壳迫使水力膨胀内壳发生径向膨胀，实现锚杆结构大变形，提供所述大变形预应力水力膨胀锚杆轴向和径向的支护阻力。本发明具有可同时施加杆体轴向和径向预应力的优点。