本发明公开了一种分布式潮流控制器多单元协调控制方法。本发明采用的技术方案为：所有DPFC单元的出力分配由协调控制器承担，其每隔一个控制周期T更新一次控制目标，然后通过判断控制目标是否发生改变，对于控制目标不变的情况下，DPFC单元的个数和出力也保持不变；而当控制目标发生改变时，协调控制器需根据新的控制目标重新制定DPFC单元分配方案，求出所需投入工作的DPFC单元个数和各DPFC单元的出力量。本发明能保证每个工作中的DPFC单元处于高效运行状态，且充分利用线路上的冗余单元，提高所有DPFC单元的平均利用率，降低单个DPFC单元的故障率，大幅度延长整个DPFC串联系统的寿命。