本发明公开了一种变压器集群管理方法及系统，包括以下步骤：步骤S1、获取变压器的运行日志，并基于所述运行日志构建表征集群管理基础特征的第一集群管理模型样本集；步骤S2、利用特征融合将第一集群管理模型样本集中的所述集群管理基础特征进行优化构建表征集群管理最优特征的第二集群管理模型样本集，并基于所述第二集群管理模型样本集构建将变压器归属至最佳管理集群的集群管理模型。本发明采用层次聚类算法将台账参数、工况数据相似的变压器划分进同一变压器集群，再通过同一集群中变压器状态监测数据的互比较了解集群内设备的差异性，能迅速判断哪台变压器处于异常状态，且异常检测准确率高。