本发明提供了一种表面增强拉曼光谱传感器检测食源性致病菌的方法，包括如下步骤：(1)在金属试纸条上固载拉曼信号分子和致病菌对应适配体的互补链段；(2)制备金属纳米包被的四氧化三铁磁性复合纳米粒，用致病菌适配体修饰所述的磁性复合纳米粒；(3)将所述的修饰后的磁性复合纳米粒固载到所述的修饰后的金属试纸条上，得到表面增强拉曼光谱传感器；(4)将所述的表面增强拉曼光谱传感器浸渍到含有致病菌的待测菌液中，反应后磁性分离，取出表面增强拉曼光谱传感器。本发明所述的表面增强拉曼光谱传感器在外磁场辅助分离下可以准确测定食源性致病菌的浓度，具有分析速度快、灵敏度高、特异性强、准确度高、操作简便等优势。