本发明公开一种考虑调控成本的综合能源系统自治调控方法及装置，方法包括：构建电‑气综合能源系统的稳态潮流模型；对电‑气综合能源系统中各个元件进行安全校验，筛选出电‑气综合能源系统中越限运行的元件，并计算电‑气综合能源系统变量间的影响因子；依据影响因子和调控成本构建Pareto最优目标函数，通过求解目标函数得到Pareto最优解集以得到最优控制方式；进一步构建电‑气综合能源系统的优化控制模型；对电‑气综合能源系统中越限运行的元件进行自治安全控制。采用的方法是依据非线性模型计算过程中的微分关系计算控制量，规避了现有技术中仅采用失真线性模型优化，使得计算速度慢、结果不准确的问题。