本发明公开一种适用于海上风电接入系统无功配置的方法及系统，属于电力系统领域。本发明方法包括：针对海上风电接入系统进行数据建模，同时选取运行方式；进行海上风电接入系统的无功平衡分析，调整低压电容器及抗器配置容量标准值，设置动态无功补偿初始值；根据陆侧电缆载流量约束进行计算分析，确定海侧配置容量，并对补偿度和功率因数下的载流量计算分析，调整载流量预设标准值；通过海缆电压分布和电磁暂态分析，调整高抗配置容量和补偿度，达到预设标准值且进行并网点电压波动分析，调整动态无功补偿预设标准值，确定配置方法；根据配置方法确定最终配置方法。本发明方法为海上风电接入工程的无功电压配置提供技术指导和支撑。