本发明公开了一种利用芽孢杆菌处理污水的方法，该方法所用芽孢杆菌为芽孢杆菌NK101，保藏于中国典型培养物保藏中心，保藏编号CCTCC NO:M2020812。将芽孢杆菌和碳源营养物投加到污水中，芽孢杆菌投加量为5～70ppm，碳源营养物投加量以投加后水体中碳氮比达20:1为准。本发明提供的方法治理成本低，见效快，稳定性好，恢复水质生态使用的芽孢杆菌和碳源糖不会对水质造成二次污染，治理后水质能够常态性保持1级A标准，污泥减量，不囤积，具有非常好的经济效益，能够做到低成本大规模应用。