本发明公开一种高效分离黑水虻养殖虫料的方法，涉及黑水虻养殖技术领域；该方法包括：1)将需要筛分的黑水虻养殖虫料经传送带或运输车运送至调质混合单元并调整含水率；2)将已调质好的养殖虫料输送至造粒单元，经圆盘造粒制成颗粒均匀且大小达到设计要求的球状物料；3)经造粒处理后的养殖虫料被输送至滚筒筛分装置，最终实现黑水虻成熟幼虫、养殖残余饵料和虫砂的分离作业；本发明操作简单、高效快速，筛分系统自动化程度高，适宜规模化、工厂化养殖处理工程应用，既可以缩短养殖空料期，使得整个养殖处理系统效率提升，又可以通过造粒处理使得黑水虻幼虫与养殖物料形状差异明显，便于后续筛分作业。