本发明提供一种变电站站控层通信方法、系统、电子设备及存储介质；所述变电站站控层通信方法，包括：客户端下发命令给服务端；服务端返回数据给客户端；客户端和服务端之间发送的命令和数据，采用的报文结构为站控层服务协议报文APDU结构。本发明提供一种变电站站控层通信方法、系统、电子设备及存储介质，客户端和服务端之间发送的命令和数据，采用的报文结构为站控层服务协议报文APDU结构；本发明站控层服务协议直接将IEC 61850‑7‑2抽象通信服务接口和IEC 61850‑7‑2模型直接映射至TCP/IP协议栈，避免了经过MMS协议栈转换的过程；二次设备厂商能够自主修改，有效保障了设备和电网安全运行。