本发明公开了伯克霍尔德菌在黄曲霉菌生物防治及花生贮存中的应用，属于有害微生物防治技术领域。本发明的伯克霍尔德菌为伯克霍尔德菌(Burkholderia latens)G12；该菌株于2020年9月25日保藏于中国微生物菌株保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号为CGMCC No.20817，保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号。该菌株对黄曲霉菌具有较好的抑制效果，采用本发明的伯克霍尔德菌G12菌悬液或全培养物或粗提物或胞外代谢物处理花生籽粒，能够显著降低贮存期黄曲霉菌对花生籽粒的侵染，延长花生的贮存期。