本申请适用于医疗影像技术领域，提供了影像驱动的脑图谱构建方法、装置、设备及存储介质。该方法包括：获取待预测的脑部的多模态数据，多模态数据是根据脑部在至少三种不同模态下采集到的影像数据得到的；将多模态数据输入预设的融合网络中处理，输出得到脑部的特征参数；融合网络对多模态数据的处理包括提取多模态数据的非欧式空间特征和欧式空间特征，并对非欧式空间特征和欧式空间特征进行超图融合得到特征参数，特征参数用于表征脑部的脑连接矩阵和/或疾病类别。将不同空间的特征映射为超图数据结构进行超图融合，避免了不同空间的特征之间可能存在的异构性，从而获得多模态数据之间互补性的融合特征。