本发明涉及一种利用黄连染料的丝肽改性棉织物的染色方法，原料组成为：氧化剂、丝肽溶液和棉织物，操作步骤包括：(1)原布准备；(2)烧毛；(3)退浆；(4)染色；所述氧化剂、丝肽溶液分别设置有三种不同浓度规格；所述氧化剂与酶退浆、碱退浆联合使用；所述步骤(3)之后棉织物还需进行漂白，选择次氮酸钠法、双氧水法和亚氯酸钠法三者中任意一种均可。该利用黄连染料的丝肽改性棉织物的染色方法采用丝肽预处理棉织物，先用高碘酸钠将棉布氧化，再将氧化棉布与丝肽溶液反应，使棉纤维上沉积固着大量的氨基、羟基等活性基团，提高其天然染料的可染性，同时赋予棉织物以丝绸的优良性能。