本发明公开了电力系统自动化控制技术领域的一种稳控系统中双套数据一致性保持方法及系统，能够在某套系统发生通道异常时，使双套系统中的数据最大程度上保持一致，不需要退出整套系统，减少了现场运维的压力。包括主站和若干个执行站，所述主站和各执行站均配置双套系统，分别为系统A和系统B，各执行站的系统A分别将数据上传至主站的系统A；各执行站的系统B分别将数据上传至主站的系统B，主站的系统A和主站的系统B通信连接；对于各执行站的数据，主站的本系统根据接收的数据有效性、与另系统的通信状态和另系统接收的数据有效性，依据决策数据交换原则，保证双套数据一致性。