本发明提供一种电池组在线均衡方法及系统，所述方法包括：获取目标锂离子电池组中所有单体电池的实时充电数据；根据所述实时充电数据进行充电曲线处理，提取每一单体电池的特征值，并记录各特征值对应的充电容量；选择任一单体电池的特征值对应的充电容量作为基准充电容量，并计算其余单体电池的特征值对应的充电容量与基准充电容量的差值；根据所述差值对相应的单体电池进行充放电的均衡控制。本发明可以实现对电池组的一致性进行有效把控，便于对电池组进行精确管理，安全性能更高。