本发明涉及表面活性剂技术领域的一种催化氧化制备脂肪醇聚醚羧酸的系统及方法。所述催化氧化制备脂肪醇聚醚羧酸的系统，包括微通道反应器，所述微通道反应器包括原料罐、催化剂装填管、微管反应器；所述原料罐依次连接催化剂装填管、微管反应器；所述原料罐中装有原料，所述原料包含反应底物脂肪醇聚醚、助催化剂、溶剂在内的混合物。本发明将脂肪醇聚醚的氧化反应放在微通道反应器中进行，利用微通道反应器受限的空间来减少双氧水分解的程度，使其达到作为氧化剂的高效利用，同时利用超高的传热特性和超高的传质特性，来大幅提高反应温度的稳定性物料混合的效率，以提高催化氧化的合成效率，同时实现了连续式反应制备脂肪醇聚醚羧酸。