本发明涉及一种智能船舶调度系统、方法及计算机存储介质，其系统包括以下模块，数据接入模块，其用于实时接入气象数据、过程时间数据、码头数据和船舶数据；排船核心模块，其用于根据实时接入的天气数据、过程时间数据、码头数据和船舶数据，采用智能泊位船舶调度方法对待排船船只进行排船，得到排船结果，并利用泊位时间轴对象对排船结果进行时间优化，且将进行时间优化后的排船结果作为最优调度方案。本发明减少人为的信息遗漏，辅助决策，提高码头运作效率。