本发明公开了一种具有外接指纹模块端口的智能终端系统及其指纹识别方法。智能终端包括音频接口、切换开关Switch、处理器CPU、电源管理单元PMU。指纹识别模块或音频模块连接音频接口，所述音频接口输出端连接电源管理单元PMU，通过数模转换读取信号以检测插入的模块，电源管理单元PMU进行信号转换后交给处理器CPU判断，并由处理器CPU通过切换开关控制线控制切换开关Switch。有益效果：智能终端的音频接口可应用于指纹识别模块，音频模块，系统可以自动辨别插入设备调控切换开关。