本发明公开了一株促进百合生长发育和/或拮抗百合病原菌的寡养单胞菌及其应用。该寡养单胞菌为嗜根寡养单胞菌(Stenotrophomonas rhizophila)，其菌株号为G44，其在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心的登记入册编号为CGMCC No.20185。该寡养单胞菌具有产铁载、产吲哚乙酸、产ACC脱氨酶等促进植物生长的特性，将其接种于百合植株，能使百合植株的生长发育明显优化，包括促进百合地上部分和地下部分生长、提前百合开花时间、延长百合生殖生长期、使百合鳞茎球鲜重增加。同时，该菌株具有对百合病原菌，例如百合灰霉病菌明显的抑制或拮抗作用。