本申请公开了一种通过柔性直流控制方式来降低母线单相短路电流的方法及系统。其中，该方法包括：采用电力系统分析软件的仿真程序，建立柔性直流换流站接入电网近区的时域仿真数据模型；根据时域仿真数据模型，设定柔性直流控制系统的控制方式为典型柔性直流控制方式；根据时域仿真数据模型，判断电网近区站点的母线单相短路电流是否超过电网近区站点配置的断路器最大开断电流；以及在母线单相短路电流超过断路器最大开断电流的情况下，将典型柔性直流控制方式的无功功率调整至预定阈值，从而降低母线单相短路电流。