本发明提供了一种中压直挂式储能系统电池运行控制方法，包括：(1)：采集电池容量、输出电压、输出电流、每组电池节点电压、荷电状态、实时电价；(2)：判断电池容量是否小于参考值，是，至(3)；否，至(1)；(3)：判断输出电压是否大于参考值，是，至(4)；否，至10)；(4)：分别判断每组电池节点电压是否大于参考值，是，充电；否，放电，至(5)；(5)：根据每组电池的荷电状态计算所有电池荷电状态平均值；(6)：将输出电流信号进行dq变换；(7)：计算每组电池的荷电状态与所在相荷电状态平均值差值；(8)：计算补偿电压分量；(9)：调整电池电压；(10)：判断实时电价是否为谷电价，若是，充电；若否，放电。