本发明公开了一种质子交换膜燃料电池膜内含水量的测量方法，属于燃料电池技术领域，包括以下步骤：预先测定燃料电池内阻中的非膜阻部分并预设于燃料电池系统中；测量膜内含水量时，通过安装在质子交换膜燃料电池正负极两端的电阻测量装置，采集燃料电池内阻，从所述燃料电池内阻中扣除预设的非膜阻部分，得到质子交换膜燃料电池膜阻，根据所述燃料电池膜阻，计算质子交换膜内含水量。本发明可以实现对燃料电池膜内含水量的在线精确监测。解决了现有技术不能精确测量燃料电池膜内含水量的问题。