本发明提出一种利用遥感影像地物边界信息进行自动化几何配准的方法及系统，包括根据待校正影像的空间分辨率和波段设置选择参考影像，并对所述待校正影像和参考影像进行图像预处理，得到待校正影像和参考影像的经纬度信息；通过提取待校正影像和参考影像的地物边界信息来突显待校正影像和参考影像中的边界线特征，掩盖非边界线特征，得到边界线影像；在边界线影像上提取预选同名点，通过特征点过滤删除其中错误的特征点，得到同名点库和基于点特征的几何配准精化模型；根据基于点特征的几何配准模型对待校正影像进行几何配准。本发明提取出地物边界信息，以此获取足够数量和质量的控制点，大幅提高航空航天及无人机遥感影像自动化几何配准的精度。