本发明涉及一种基于超短脉冲激光器的防尘式水冷系统。本发明的目的是解决现有超短脉冲激光器存在激光器内部较大的温度变化易造成光束指向偏移、空气中大量悬浮的颗粒物极易进入激光器内部污染光学镜片和晶体，造成能量损失，使光学镜片烧坏的技术问题，提供一种基于超短脉冲激光器的防尘式水冷系统。该系统为超短脉冲激光器及其发热程度较大的各个元件底部，尤其是放大压缩水冷模块及放大压缩水冷模块内发热程度较大的各个元件底部，分别设置了水冷板或水冷座，结合循环水路的合理设置，起到充分水冷作用，使得超短脉冲激光器输出光保持良好的光束指向稳定性，还为光纤进线孔和出光孔处均设置了固定密封结构，以避免悬浮颗粒物进入激光器内部。