本发明提供一种烤烟井窖式移栽覆膜插孔机，包括双机架结构、主液压缸、推杆液压缸、插孔器和控制器；双机架结构包括可动机架和固定机架，可动机架位于固定机架的下方；可动机架和固定机架滑动连接；主液压缸安装在主液压缸承载板上，主液压缸承载板安装在固定机架上；主液压缸的液压杆与可动机架连接；推杆液压缸的液压杆与活塞推板连接，活塞推板与上插孔器连接板连接，活塞推板与上插孔器连接板安装在可动机架上，插孔器连接板上设有推杆；可动机架上设有多个插孔器，推杆穿过插孔器的顶部。本发明解决了传统移栽打孔出现的问题，不仅可以完成自动化打孔，一次性可打多孔，且该打孔机悬挂于拖拉机上，大大提高了插孔过程中的工作效率。