本发明公开了番茄富含羟脯氨酸系统素前体蛋白基因SlHypSys在提高植物对黄萎病抗性中的应用，通过番茄中克隆富含羟脯氨酸的系统素前体蛋白基因SlHypSys，采用分子生物学的方法，构建SlHypSys组成性表达的植物表达载体，然后再利用基因工程方法，将SlHypSys基因导入植物，获得了正常转录表达的转基因拟南芥、烟草和棉花株系；获得的转基因植株病情指数都显著低于野生型对照，对黄萎病的抗性显著提高，表明SlHypSys基因能够用于提高植物对黄萎病的抗性，对植物抗病基因工程具有重要意义。