本发明公开了一种小分子水处理设备，属于水处理技术领域，解决了现有装置中过滤层容易堆积杂质，降低了装置的过滤效率的问题；其技术特征是：包括箱体，箱体内设置有处理腔，箱体的上表面中心位置设有用于进样的注水口，处理腔和注水口连通，处理腔的中部设置有用于对水体过滤的活性炭过滤网组件，活性炭过滤网组件的上方设置有缓冲腔，缓冲腔的两侧连接有防堵塞组件；本发明实施例设置了防堵塞组件，防堵塞组件的设置避免了活性炭过滤网组件的堵塞，同时活性炭过滤网组件的设置实现了对水体的过滤，加热组件的设置不但实现了对处理腔内水体搅拌混合，同时打破了处理腔内水体运动的动态平衡，利于对水体的加热，提高了水处理效率。