本发明属于应用软件配置领域，公开了一种应用软件配置管理方法、装置及系统，当配置管理服务器与应用软件服务器之间设置隔离装置时，该方法包括：获取应用软件的配置数据；将应用软件的配置数据及对应的应用软件服务器的地址转换为预设传输格式的配置信息，将配置信息发送至第一通信服务器；配置信息被第一通信服务器同步至第二通信服务器后，还原为应用软件的配置数据及对应的应用软件服务器的地址，并同步至对应的应用软件服务器。解决了当配置管理系统与应用软件服务器分处建立有隔离装置的区域时，由于隔离装置导致无法进行网络传输，无法实现配置同步的问题，实现跨隔离装置的配置数据传输同步。