本发明公开了一种基于EMD‑WFFT时变宽带多普勒补偿方法。步骤1：使用训练序列进行同步；步骤2：将步骤1中的训练序列去掉循环前缀；步骤3：将步骤2得到的信号乘小波函数后再进行WFFT处理；步骤4：将步骤3中经过WFFT处理后的数据再通过EMD处理观测频偏分量；步骤5：将步骤4中EMD处理观测频偏分量后进行重采样，完成对宽带多普勒的粗补偿；步骤6：在经过粗补偿处理后的数据输入自适应梯度算法；步骤7：将数据输入自适应梯度算法后，再通过载波进行信道均衡，去除ICI，对多普勒进行补偿。本发明为了解决水声通信系统的信道估计问题。