本发明公开一种变电站直流电源电池管理系统及其电池管理方法，电池管理系统包括直流母线、断路器、DC/DC升降压电路和放电旁路S3，直流母线的正极和负极分别与断路器的两个单刀闸连接，DC/DC升降压电路和放电旁路S3并联连接，DC/DC升降压电路和放电旁路S3组成的并联电路与断路器串联连接，DC/DC升降压电路和放电旁路S3组成的并联电路与电池模块串联连接；电池模块包括至少两个电池单体单元，电池单体单元与电池管理单元BMS连接，电池管理单元BMS与运维护单元通讯连接；DC/DC供电电源与电池管理单元BMS供电连接，DC/DC供电电源与断路器串联连接；其能够对电池实现实施状态监控、均衡工作，进行过充和过放保护，能够有效延长其寿命。