本发明公开了一种SDN架构下基于MPTCP的异构网络切换方法和系统，所述方法包括：SDN控制器综合来自网络侧与移动终端侧的信息作出切换判断后，向移动终端发出切换指令，指定切换的目标网络；所述移动终端接收到所述切换指令后，新建一个MPTCP会话，该会话包含了使用目标网络所建立的子流subflow；所述移动终端将正在传输的业务的数据包从原始MPTCP会话转交到新建的MPTCP会话进行传输；其中，所述原始MPTCP会话包含了使用原始网络所建立的subflow。应用本发明可以可以保证异构网络切换场景下移动终端的业务数据传输的连续性。