一种电力现货市场环境下计划与市场两次解耦结算方法及系统，包括以下步骤：基于非市场用户用电需求预测分配机组的基数电量计划；获取市场主体的日前出清电量，基于市场主体的日前出清电量，以及市场机组的基数电量计划确定市场机组日前应结基数电量；获取市场主体的实际发用电量，基于市市场主体的实际发用电量和日前出清电量，以及市场机组的基数电量计划确定市场机组实时应结基数电量；对市场主体进行双偏差结算。采用本发明所提方法可以保证整个市场各成分电量发用两侧的匹配，包括计划电量、日前偏差电量、实时偏差电量，从而避免了由于基数电量分配不合理产生不平衡资金。